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本发明公开了一种生物菌种保存装置，具体涉及生物菌种技术领域，包括机架和动力部件，还包括设置在机架上方的包装组件和设置在包装组件下方的顶料组件，包装组件包括与机架固定安装的顶板、设置在顶板两侧并与顶板滑动连接的夹板，顶料组件包括可被动力部件带动竖向移动的顶料柱，顶料柱将生物菌种送至两个夹板之间。本发明通过包装组件、顶料组件、连杆组件的设置，在顶料柱向上移动时，可以实现生物菌种的进料，也可以使两个夹板打开上料筒一和上料筒二的底部使半盒一和半盒二落下，在顶料柱向下移动时，可以使两个夹板推动半盒一和半盒二对生物菌种进行包装保存，自动化程度高，一次往复移动可以实现一个生物菌种的包装保存。
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